手游大掌门作为一款武侠题材的策略卡牌游戏，副本系统是其核心玩法之一，玩家可通过挑战各类副本获取资源、提升实力。游戏中的副本主要分为基础挑战本、试炼本、竞技场、首领本、门派副本以及特殊活动副本等类型，每种副本的设计目标和奖励机制各有侧重，需要玩家根据自身实力和需求选择适合的挑战方向。
基础挑战本是玩家接触最早的一类副本，主要用于提升弟子等级和角色等级，难度相对较低，适合新手熟悉游戏机制。试炼本则分为简单和进阶两种难度，玩家需先通关简单模式才能解锁进阶挑战，其难度显著高于基础副本，但奖励也更丰厚。竞技场采用玩家实时对战模式，胜负取决于阵容强度和策略搭配，排名越高获得的奖励越稀有。首领本需要玩家组队协作，通过特定技巧削弱高血量、高输出的首领，完成后可获取珍贵资源。
门派副本和特殊活动副本是游戏后期的重要内容。门派副本要求玩家与同门派成员组队挑战，成功后可提升门派声望并解锁专属奖励。特殊活动副本通常与节日或版本更新相关，例如藏兵阁生死窟等，这类副本往往限时开放，奖励包括限定装备、稀有道具甚至绝版侠客。跨服副本允许不同服务器的玩家组队，进一步拓展了社交与挑战的维度。
副本的星级评价机制是玩家需要重点关注的系统。首次以三星评价通关副本可获得三倍经验和威望奖励，后续重复挑战时可跳过战斗直接领取奖励，大幅提升效率。部分副本如血战襄阳武林大会还设有排行榜功能，玩家可通过累积积分兑换高阶资源。合理分配体力与挑战次数，优先完成高收益副本，是长期发展的关键策略。
手游大掌门的副本体系兼顾了多样性与深度，从单人闯关到团队协作，从日常刷资源到限时冲排名，玩家需根据阶段目标灵活调整挑战重心。掌握副本机制、优化阵容搭配，并适时参与高性价比活动，方能高效提升战力，体验完整的江湖征程。
